Voriacare · Edge Cardiac-CT · Phase 2
CCTA — Segment động mạch vành
Phân đoạn lòng động mạch vành từ CTA. Khác EAT: có nhãn VÀNG (gold) từ ImageCAS — supervised thật.
Trạng thái trực tiếp (tự cập nhật 30s): đang chạy — …
Phase
…
build→preprocess→train
Epoch
—
/500
EMA pseudo Dice
—
coronary (held-out)
Epoch time
—
GB10
Cập nhật (auto): —. Nguồn: nnU-Net training_log trong results/Dataset501_Coronary/….
2Kết quả — held-out (nhãn gold) Xong
500-ep Held-out Dice
0.799
200 ca · IoU 0.669
100-ep (baseline)
0.743
held-out
EMA pseudo (train)
0.828
val-split
Nhãn
GOLD
ImageCAS thật
Đạt benchmark: Dice held-out 0.799 (500 epoch) — đúng dải nnU-Net trên ImageCAS (~0.80–0.82). Cải thiện rõ so 100-ep (0.743 → 0.799, +5.6đ).
Đây là Dice vs nhãn VÀNG thật → đáng tin về nhãn (khác EAT dùng silver proxy). Coronary Dice thấp hơn pericardium là đúng bản chất (mạch mảnh, foreground ~0.15%).
3Bối cảnh & điểm khác EAT
Lợi thế lớn: ImageCAS đi kèm nhãn động mạch vành do chuyên gia (gold) — nên CCTA là supervised với nhãn thật,
KHÔNG phải silver proxy như EAT. Kết quả CCTA đáng tin hơn về mặt nhãn.
1 · Data
CT + gold label
→
2 · Build
Dataset501
→
3 · Preprocess
nnU-Net plan
→
4 · Train
3d_fullres
→
5 · Test
Dice held-out
4Dữ liệu — ImageCAS gold coronary 1000 ca
Ca có nhãn
1000
0 corrupt
Nhãn
Binary
0=bg · 1=vành
Foreground
~0.15%
mất cân bằng lớn
Split
fold_0
nnU-Net 800/200
Nhãn <id>.label.nii.gz giải nén từ ImageCAS (lòng động mạch vành). Split chính thức (xlsx) dùng patient-ID gốc
≠ đánh số 1-1000 của bộ zip → tạm dùng fold_0 tự chia của nnU-Net; split chính thức để bước benchmark sau.
5Kế hoạch (mirror EAT) đang chạy
| Bước | Chi tiết | Trạng thái |
|---|---|---|
| Extract nhãn vành | 1000 ca *.label.nii.gz | Xong |
| Build Dataset501_Coronary | imagesTr symlink + labelsTr (uint8 0/1) + dataset.json | … |
| Preprocess 3d_fullres | nnU-Net plan + fingerprint (oversample foreground do imbalance) | chờ |
| Train (500 epoch) | nnU-Net 3d_fullres · ~500 epoch | chờ |
| Test held-out | Dice động mạch vành = 0.799 (500-ep) | Xong |
6Ghi chú trung thực & roadmap
- Task khó: động mạch vành mảnh + foreground ~0.15% → Dice kỳ vọng ~0.80–0.85 (không phải 0.96 như pericardium). Đây là mức benchmark ImageCAS.
- Nhãn gold → kết quả CCTA đáng tin về nhãn (khác EAT proxy). Nhưng vẫn là segmentation lòng mạch, chưa phải chẩn đoán hẹp (stenosis).
- Roadmap: sau segmentation → centerline → đo hẹp (CAD-RADS) / mảng xơ vữa. Và thử STU-Net transfer cho CCTA (đã thắng ở EAT).
7Gallery 3D — cây động mạch vành (GOLD vs Prediction) 12 ca held-out
Mỗi ca: nhãn GOLD (trái) vs Prediction nnU-Net (phải), kèm Dice(pred,gold). Ca held-out (model không thấy khi train).
Đọc đúng: đây là cây động mạch vành 3D dựng từ mask (marching cubes). Prediction bám khá sát gold ở nhánh chính; nhánh xa/mảnh dễ đứt đoạn (đúng bản chất coronary khó). Đây là kết quả segmentation, chưa phải chẩn đoán hẹp.